ACNUR reparte materiales básicos de higiene y mosquiteras a los refugiados, para protegerlos de enfermedades como el cólera y la malaria principalmente en África. Igualmente, además de ofrecer asistencia sanitaria, se llevan a cabo actividades de formación y sensibilización en los campos para concientizar sobre la importancia de mantener una buena salud e higiene y para informar sobre enfermedades como el SIDA o la hepatitis. Del mismo modo, se llevan a cabo campañas de vacunación para los niños y, en aquellos casos en los que se detectan enfermedades o casos de heridos graves, ACNUR trabaja para facilitar el acceso de los refugiados a los tratamientos necesarios en los hospitales locales.

Para los casos más graves, la Agencia trabaja para promover plazas de reasentamiento en terceros países para que estos refugiados que tienen enfermedades crónicas o muy graves, puedan recibir el tratamiento que necesitan y llevar una vida digna.